Sungai Madagascar mempunyai aliran jeram. Semua sungai utama pulau mengalir dari timur ke barat.
Sungai Betsibuka
Dasar sungai terletak di kawasan barat laut pulau. Panjang keseluruhan arus ialah 525 kilometer. Dan ini adalah salah satu sungai pulau terbesar. Betsibuka dicirikan oleh warna coklat kemerahan khas airnya. Penjelasan untuk fenomena ini sangat sederhana - perairan sungai mengandungi sejumlah besar sedimen yang dibawa oleh sungai ke laut.
Sumber sungai terletak di tengah pulau (utara provinsi Antananarivo). Sungai ini berasal dari pertemuan dua sungai - Amparihibe dan Dzabu. Setelah itu, Betsibuka berangkat ke utara, menyusuri perairan Sungai Ikupa (berhampiran bandar Maevatanana). Betsibuca mengalir ke perairan Teluk Bumbetuca (Selat Mozambik), membentuk delta ketika jatuh. Dasar sungai dapat dilalui sejauh 130 kilometer dari tempat pertemuan.
Warna air kemerahan di sungai merupakan tanda bencana ekologi. Penebangan hutan di permukaan pulau telah mempercepat proses hakisan tanah. Hasilnya, jumlah tanah yang dihanyutkan oleh air sangat besar. Dan kerana ini kebanyakannya adalah tanah laterit merah, maka teduhan air.
Sedimen yang dibawa oleh sungai di perairannya menetap di dasar muara Betsibuk. Dan ini adalah salah satu sebab berlakunya kelonggaran dasar Teluk Bumbetuka. Oleh sebab itulah, pelabuhan kota Mahajanga, yang terletak di sini, dipindahkan ke pantai luar pulau itu, kerana ada ancaman mendarat kapal-kapal laut yang melintang.
Sungai Mangoki
Sungai mengalir melalui daratan di bahagian barat daya pulau. Panjang keseluruhan arus Mangoki ialah 564 kilometer. Dan itu adalah sungai terpanjang di Madagascar.
Sumbernya terletak di wilayah Fianarantsoa (lereng Central Ridge). Sungai kemudian mengalir ke arah barat, melewati daratan provinsi Tuliara. Tempat pertemuan adalah perairan Selat Mozambik (berhampiran bandar Morombe). Apabila mengalir ke dalamnya, ia membentuk delta besar.
Saluran Mangoki melalui kawasan yang sukar. Bahagian selatan delta kaya dengan pulau-pulau penghalang, beting dan ludah aluvial. Bahagian utara delta menawarkan banyak paya dan bakau.
Sungai Maninguri
Sungai Maninguri terletak di bahagian timur Madagascar dan mempunyai panjang keseluruhan 260 kilometer. Sumber sungai adalah di Tasik Alautra. Luas lembangan sungai adalah 12,645 kilometer persegi. Sungai dicirikan oleh arus bergelora. Tempat pertemuan adalah perairan Lautan Hindi (berhampiran bandar Ampasina).
